该杂志刊期列表
- 2026年
- 1期
国内刊号:13-1101/S
国际刊号:1000-7091
发布日期:
作者:任姝锦, 蔡锋锋, 马婷, 王婷, 施玉安, 王一丹, 杨成德
单位:甘肃农业大学 植物保护学院,甘肃省农作物病虫害生物防治工程实验室,甘肃 兰州 733070
关键词:枯草芽孢杆菌,解旋酶基因,克隆,生物信息分析,亚细胞定位,
基金:甘肃省重点研究项目(24ZDNA009-2)
枯草芽孢杆菌ZA1具有良好的抑菌和促生作用。解旋酶已被证实为核酸代谢关键蛋白复合体,且解旋酶超家族成员通过特异性切割DNA/RNA分子中的磷酸二酯键,在遗传信息传递过程中执行关键催化功能。为明确解旋酶基因ypvA和yjcD在枯草芽孢杆菌ZA1抑菌过程中的潜在作用,以枯草芽孢杆菌ZA1为材料,克隆ypvA和yjcD基因,利用生物信息学分析它们的序列特征,通过亚细胞定位检测2个基因的位置,对2个基因及其编码蛋白的结构与功能特性进行初步解析。结果表明,克隆获得的ypvA和yjcD基因编码区全长分别为1 791,1 767 bp,分别编码596,588个氨基酸,其编码蛋白的预测相对分子质量分别为68.804 01,68.275 08 ku,理论等电点分别为4.81,8.25,且亲水性较弱。ypvA和yjcD的蛋白空间结构主要由α-螺旋、β-折叠和大量无规则延伸链组成的紧密结构。亚细胞定位于细胞质和细胞核中,不存在跨膜区及信号肽,为非分泌蛋白。分析保守结构域得到ypvA属于Rad3相关DNA解旋酶DinG家族,基因yjcD属于UvrD超家族I DNA或RNA解旋酶,通过进一步的蛋白质系统进化树分析明确将这2个蛋白鉴定为ATP依赖性解旋酶。因此,通过克隆枯草芽孢杆菌ZA1中的ypvA和yjcD基因并分析序列为非分泌性ATP依赖性解旋酶。
来源:2025年第S1期
《华北农学报》期刊编辑部