华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2025年第5期:花魔芋AkTCP家族基因鉴定及表达分析

发布日期:

作者:何斐, 汤鑫塬, 李竹梅, 褚洪龙

单位:1 安康学院 现代农业与生物科技学院, 陕西 安康 725000;2 安康学院 富硒魔芋陕西省高校工程研究中心, 陕西 安康 725000;3 曲靖师范学院 生物资源与食品工程学院, 云南 曲靖 655011

关键词:花魔芋,TCP基因家族,转录因子,表达分析,

基金:国家自然科学基金项目(31901468); 国家自然科学基金项目(1860057); 云南省科技厅基础研究专项面上项目(202401AT070002); 安康市科技计划项目(AK2022-NY-04); 安康学院专项(2023AYKCYZ05); 安康学院专项(2024AYXNZX04); 曲靖师范学院博士创新团队支持计划项目

TCP家族成员是植物特有的转录因子,在植物生长、代谢活动及逆境应答等关键生物过程中发挥不可或缺的作用。为了解TCP基因家族在花魔芋基因组中的数量、分布和表达等情况,利用生物信息学技术对AkTCP家族基因进行鉴定,分析该家族成员的理化性质、亚细胞定位、共线性、基因结构及进化关系,采用qRT-PCR技术分析响应生物、非生物胁迫的基因表达情况。结果表明,花魔芋全基因组中鉴定出30个TCP家族成员,其蛋白包含135~562个氨基酸残基,分子质量为15.08~57.20 ku,等电点为4.96~11.49,大部分为碱性蛋白,均为不稳定的亲水性蛋白,主要分布在细胞核上,其基因在染色体上不均匀分布。AkTCP共线性基因仅在花魔芋8条染色体中分布,包含4个染色体间共线性事件和5个染色体内共线性事件。AkTCP基因结构较为简单,大部分不含内含子,均含有高度保守的TCP结构域,可分为Class Ⅰ和Class Ⅱ 2个组别,Class Ⅱ又分为CIN和CYC/TB1 2个亚类。启动子顺式作用元件分析结果显示,AkTCP启动子上含有多个生理响应、光响应、植物激素和逆境胁迫响应等元件。qRT-PCR分析结果表明,AkTCP家族成员参与了干旱胁迫、盐胁迫、茉莉酸甲酯和软腐病原菌侵染应答过程并作出积极响应。

来源:2025年第5期

《华北农学报》期刊编辑部

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