华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2025年第5期:基于转录组分析挖掘影响甘蓝型油菜含油量积累的候选基因

发布日期:

作者:李文, 姚敏, 贺丹, 邱萍, 何昕, 熊兴华, 刘忠松, 钱论文

单位:1 湖南农业大学 农学院, 湖南 长沙 410128;2 岳麓山实验室, 湖南 长沙 410082

关键词:甘蓝型油菜,含油量,转录组分析,共表达网络,全基因组关联分析,

基金:湖南科技创新领军人才项目(2023RC1063); 湖南省杰出青年科学基金项目(2022JJ10027)

为了明晰甘蓝型油菜油脂积累的调控网络,选育高含油量油菜品种。以4个油菜自交系材料开花后25,35,45 d的种子转录组数据为样本,基于转录组和关联分析结合挖掘影响含油量的候选基因。转录组分析检测到1 530个基因在3个不同时期都存在差异表达,其中包括986个上调表达基因和544个下调表达基因。对这些差异表达基因进行GO富集分析,检测到83个油脂合成基因,79个油脂降解基因,21个油脂转运基因和80个转录因子。对差异表达转录因子进一步分析,检测到BnTT8、BnGL2、BnNAC082等基因。结合50份重测序甘蓝型油菜在2 a 3个不同区域的含油量表型,利用全基因组关联分析(GWAS)检测到BnNAC082-A03基因外显子区域的4个SNP与含油量显著关联,并检测到该基因区域存在2个单体型等位基因且BnNAC082-A03_Hap1对应材料的含油量显著高于BnNAC082-A03_Hap2对应材料。利用分析获得的转录组数据构建共表达网络,在子网络中检测到BnNAC082-A03与BnTT8-A09和BnGL2-C06直接相连,形成了影响种子油脂积累的潜在分子调控网络。

来源:2025年第5期

《华北农学报》期刊编辑部

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