华北农学报

作者：毛馨缘, 杜怀东, 董悦, 于雪然, 王敬文, 李培富

单位：1 宁夏大学 农学院,宁夏优势特色作物现代分子育种重点实验室,宁夏 银川 750021；2 赤峰市农牧科学研究所,内蒙古 赤峰 024000

关键词：水稻,籽粒,总蛋白含量,全基因组关联,候选基因,

基金：宁夏回族自治区粮食作物种质创制与生长调控创新团队(2022BSB03109); 宁夏农业育种专项课题(2018NYYZ0302)

为了优良品质稻米的培育,利用来自国内外139份水稻种质资源为材料,对2022-2023年水稻籽粒总蛋白含量进行表型分析,结合全基因组测序(覆盖深度10×)所得255 501个SNP标记,利用一般线性模型进行全基因组关联分析,避免假阳性影响选取阈值最高位置的基因进行单倍型分析,根据前人研究结果和基因功能注释预测水稻籽粒总蛋白含量相关基因,通过实时荧光PCR对预测基因进行相对表达量分析。结果表明,139份水稻籽粒总蛋白含量属于中度变异,变异系数分别为21.66%,20.65%,符合正态分布;通过全基因组关联分析,在2个环境下共获得显著SNPs 55个,分布在1,2,4,5,6,8,11,12号染色体上,其中有16个连续且上下游区间不超过100 kb的SNPs分布于11号染色体;进一步对11号染色体显著SNPs位点的上、下游50 kb(±50 kb)范围内的区间关联性强的基因进行单倍型分析,结合基因功能注释以及灌浆期籽粒相对表达量分析的结果,初步推测LOC_Os11g08460与水稻籽粒总蛋白含量相关,编码Dnak/Hsp70s蛋白家族。综上,利用全基因组关联分析对139份水稻种质资源的总蛋白含量进行候选基因预测及单倍型分析,为稻米品质遗传改良提供新的基因,加速稻米改良的过程。

来源：2025年第4期

《华北农学报》期刊编辑部

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