华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2025年第4期:禽腺病毒血清4型感染LMH细胞的环状RNA表达分析

发布日期:

作者:殷冬冬, 朱梦琪, 兰梦蝶, 朱星星, 尹磊, 沈学怀, 王洁茹, 赵瑞宏, 戴银, 潘孝成

单位:1 安徽省农业科学院 畜牧兽医研究所,安徽省畜禽疫病研究中心,安徽 合肥 230001;2 安徽省畜禽产品安全重点实验室, 安徽 合肥 230001;3 安徽农业大学 动物医学院,安徽 合肥 231200;4 宁国市动物卫生监督所,安徽 宁国 242300

关键词:禽腺病毒血清4型,LMH细胞,转录组测序,环状RNA,差异表达,

基金:财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-40); 安徽省农业科学院科研平台项目(2024YL016); 安徽省现代农业产业技术体系(AHCYJXTX-05-13)

为分析禽腺病毒血清4型(FAdV-4)感染鸡肝癌细胞(LMH)后环状RNA(circRNA)的表达谱变化,进一步研究circRNA在FAdV-4感染过程中的调控作用,以FAdV-4感染的LMH和未感染细胞为对象进行转录组测序,对差异表达circRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,通过实时荧光定量 PCR(qRT-PCR)对随机挑选的5个circRNA进行验证。结果表明,感染组和未感染组的circRNA分布于绝大多数染色体上,且长度主要集中在300~1 000 bp。差异表达分析筛选出72个circRNA,32个circRNA表达水平显著上调,40个circRNA表达水平下调。GO功能分析,差异circRNA来源基因主要富集在细胞过程、代谢过程、催化活性和核酸结合转录因子活性等进程。KEGG通路分析显示,差异表达circRNA主要富集在Notch信号通路、RNA降解和MAPK信号通路。qRT-PCR结果表明,被验证的5个circRNA表达水平与测序结果趋势一致,进一步验证了测序结果的可靠性。本研究对FAdV-4感染LMH细胞的circRNA表达谱进行分析,并筛选出差异表达的circRNA,为探究circRNA在FAdV-4感染过程中的功能及宿主与FAdV-4互作机制提供数据支持。

来源:2025年第4期

《华北农学报》期刊编辑部

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