华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2025年第3期:野生蒜芥茄SsRPM1基因的生信分析、亚细胞定位及表达分析

发布日期:

作者:胡雨莹, 孙茂, 汪骞, 黎志彬, 鲍锐, 桂敏, 钟秋月, 杜光辉, 吴丽艳

单位:1 云南省农业科学院 园艺作物研究所,云南 昆明 650205;2 云南大学 农学院,云南 昆明 650500

关键词:野生茄,<i>RPM1</i>基因,黄萎病,生物信息学,亚细胞定位,基因表达,

基金:云南省农业基础研究联合专项面上项目(202301BD070001-052); 云南省重大科技计划专项(202302AE090006); 临沧国家可持续发展议程创新示范区科技专项(202204AC100001-A06)

为了探究NBS-LRR类基因RPM1在茄属植物抗黄萎病中的作用,以茄属中的野生茄-蒜芥茄为材料,在其转录测序的基础上,克隆RPM1基因同源序列,分析该序列编码蛋白的理化性质、分子结构,构建进化树,以及在烟草中进行亚细胞定位,同时检测蒜芥茄不同部位中RPM1基因的相对表达量,以及在接种大丽轮枝菌(黄萎病病原菌的一种)后4个时间点(0,24,48,72 h)的相对表达量。结果发现,在蒜芥茄中RPM1基因(命名为SsRPM1)序列全长2 772 bp,编码 924 个氨基酸。SsRPM1蛋白总分子质量为105.99 ku,是不存在跨膜结构的碱性亲水蛋白,该蛋白主要由α螺旋和无规卷曲构成,包括LRR、NBC和CC 3种结构域,欧白英RPM1蛋白与其亲缘性关系最近;在烟草中的亚细胞定位发现该蛋白位于细胞膜上;SsRPM1基因在蒜芥茄的不同器官(根、茎、叶)中均有表达,其中茎的相对表达量最高,其次是叶,最后是根。在接种大丽轮枝菌后,总体上看,对照组和接菌处理组的SsRPM1基因表达情况皆呈现先上升后下降的趋势,在24 h最高。与对照组相比,接菌处理组的基因相对表达量较低,暗示蒜芥茄SsRPM1是响应黄萎病胁迫的负调控基因。

来源:2025年第3期

《华北农学报》期刊编辑部

查看华北农学报杂志2025年第3期

声明

严正声明:本站非期刊官网,非中介代理。

本站仅提供学术规范服务:快速预审、润色编辑服务、中英文查重、降重、去重服务、推荐合适的期刊投稿等学术规范服务。 如需提供学术规范服务请联系在线编辑。

联系我们

  • 地址:石家庄市和平西路598号
  • 电话:0311-87652166
  • E-mail:hbnxb@163.com

咨询工作人员