华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2025年第2期:基于BSA-seq和RNA-seq技术挖掘黄瓜白粉病抗性基因

发布日期:

作者:秦垒, 张巧英, 孙雷, 石昊颖, 檀海斌, 石学萍

单位:1 河北工业大学 理学院,天津 300401;2 河北省科技创新服务中心,河北 石家庄 050051;3 河北省农林科学院 生物技术与食品科学研究所,河北省植物转基因中心,河北 石家庄 050051;4 河北农业大学 资源与环境科学学院,河北 保定 071000

关键词:黄瓜,BSA-seq,RNA-seq,白粉病,定位,

基金:河北省重点研发计划项目(21326342D)

黄瓜白粉病是危害黄瓜生产的主要病害之一,制约了黄瓜的安全生产。定位黄瓜抗白粉病相关基因,有助于理解黄瓜对白粉病抗性的遗传规律和分子机制,也为抗病育种提供了多样化的基因资源。以黄瓜抗病自交系QK和感病自交系QG为亲本,构建了QK×QG的 F1、F2 群体。采用极端性状混池重测序(BSA-seq)的方法对黄瓜白粉病抗性基因进行初步定位,结合转录组数据和基因注释信息对抗病表型关联区间进行缩短,发掘序列变异,筛选关键基因。人工接种结果显示:F1 植株全部表现感病,说明白粉病杭性可能由隐性基因控制;F2群体表现出从抗病到感病的连续正态分布。利用BSA-seq、SNP-Index 方法和QTG-seq法,分析结果的交集为5号染色体的19—21 Mb区段,该区段共有77个注释基因在样本间存在SNP差异,其中非同义突变共有33个。转录组测序(RNA-seq)结果显示,感病材料中共有309个上调基因,697个下调基因。在5号染色体的候选区段内有13个基因的表达量在接病后差异显著,基于差异表达基因和BSA分析结果将该区段内的候选基因缩减为3个,其中仅LOC101207011基因内检测到SNP突变。候选基因LOC101207011是由第656位的Val突变为了Leu,实时荧光PCR也验证该基因与黄瓜抗白粉病具有连锁关系。

来源:2025年第2期

《华北农学报》期刊编辑部

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