华北农学报

作者：张琴琴, 侯广广, 李畅, 代博文, 王晓芳, 解紫薇, 樊蜜, 吴晓蕾, 高洪波, 李敬蕊

单位：河北农业大学 园艺学院,农业农村部华北节水农业重点实验室,河北省绿色高效蔬菜产业省部共建协同创新中心,河北 保定 071001

关键词：生菜,基因家族,LsACA,钙,表达分析,

基金：河北省科学技术厅重点研发项目(21326903D)

ACA作为Ca2+-ATPase的亚家族成员之一,在维持植物细胞内Ca2+浓度平衡以及调节植物生长发育响应非生物胁迫等方面发挥着重要的作用。为进一步了解生菜ACA基因家族功能,运用生物信息学方法对生菜ACA基因家族成员进行鉴定与分析。结果表明:在生菜中共鉴定到17个ACA基因,命名为LsACA1~LsACA17;LsACA基因不均匀地分布在8条染色体上;亚细胞定位预测结果表明,LsACA蛋白全部定位于细胞质膜;LsACA基因家族成员之间的内含子数量差异较大(0~32个),LsACA蛋白共鉴定到15个保守结构域,氨基酸数量为21~50个;二级结构占比情况为:α-螺旋>无规则卷曲>延伸链>β-折叠;根据系统发育分析将LsACA蛋白分为5个亚家族Group Ⅰ~Group Ⅴ;根据共线性分析发现,6对基因存在片段复制,其共线性基因对的Ka/Ks均小于1,说明在进化中以纯化选择为主。通过qRT-PCR方法分析了LsACA基因家族成员在不同钙离子浓度处理下的表达模式,结果表明:与对照相比,低钙处理的钙敏感型品种宝石绿中有12个LsACA基因表达量极显著下调,而钙不敏感型品种耶罗有9个LsACA基因表达量极显著上调,1个LsACA基因表达量显著上调。研究鉴定了生菜ACA基因家族成员,并进行了生物学分析,揭示了LsACA基因家族成员的特征。

来源：2025年第1期

《华北农学报》期刊编辑部

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