华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2025年第1期:lncRNA TCONS_00143126在奶牛乳腺上皮细胞炎症反应中的表达及生物信息学分析

发布日期:

作者:冯芬, 李彦霞, 王晋鹏, 董益闻, 罗仍卓么, 王兴平

单位:1 宁夏大学 动物科技学院,宁夏 银川 750021;2 西北农林科技大学 动物科学技术学院,陕西 杨凌 712100

关键词:奶牛,lncRNA <i>TCONS_00143126</i>,乳腺上皮细胞,炎症,生物信息学分析,

基金:国家自然科学基金项目(32172709); 宁夏自然科学基金项目(2023AAC03049); 现代农业产业技术体系(CARS-36)

为了深入探究lncRNA TCONS_00143126在E.coli型奶牛乳腺炎中的表达模式及其生物学功能,采用奶牛乳腺上皮细胞的cDNA为模板,运用PCR克隆及测序技术来确认lncRNA TCONS_00143126的存在,并进行lncRNA的亚细胞定位分析、预测可能靶向的miRNA及靶基因,并通过KEGG通路富集分析探讨其在奶牛乳腺炎中的潜在作用机制。此外,采用LPS诱导bMECs以构建奶牛乳腺炎体外模型,并通过RT-qPCR技术检测lncRNA TCONS_00143126在LPS诱导bMECs 6,12,24 h的表达情况。结果表明,lncRNA TCONS_00143126是真实存在的,在LPS诱导的bMECs中的表达量显著上调,且主要分布于细胞核中。靶基因预测及KEGG富集分析结果显示,lncRNA TCONS_00143126可能通过靶向的miRNA(bta-miR-133a、bta-miR-193a-5p和bta-miR-375等)和靶基因(IFNE、SLC2A10、MEX3B)来调节JAK-STAT、mTOR和MAPK等炎症信号通路,进而在奶牛乳腺上皮细胞炎症中发挥作用。

来源:2025年第1期

《华北农学报》期刊编辑部

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