华北农学报

作者：马荣, 路建卫, 赵雪, 扎老, 成述儒, 喇永福, 吴晓云, 包鹏甲, 郭宪, 梁春年

单位：1 中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,甘肃 兰州 730050；2 甘肃农业大学,甘肃 兰州 730070；3 合作市农畜产品质量安全检测检验中心,甘肃 合作 747000；4 合作市佐盖多玛乡畜牧站,甘肃 合作 747000

关键词：牦牛,<i>Akirin1</i>基因,克隆,生物信息学分析,组织表达分析,

基金：合作市牦牛种质提升与提质增效项目; 现代肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37); 甘肃省基础研究创新群体项目(20JR5RA580); 甘肃省科技重大专项(21ZD10NA001); 甘肃省科技重大专项(GZGG-2021-1); 中国农业科学院创新工程(25-LIHPS-01)

为探究牦牛Akirin1基因的序列特征,详细了解其组织表达特性。以甘南牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用RT-PCR技术克隆甘南牦牛Akirin1基因CDS序列,并使用多种生物在线软件及工具进行生物信息学分析,再利用qPCR技术检测Akirin1基因在甘南牦牛心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪和睾丸组织中表达差异。结果显示,甘南牦牛Akirin1基因CDS长579 bp,共编码192个氨基酸,基因编码的蛋白分子式为C964H1525N275O291S8,蛋白理论等电点为8.91,不稳定系数和总平均亲水性分别为84.14,-0.822,属于不稳定亲水性蛋白;蛋白潜在磷酸化位点有29个,分别为14个丝氨酸,11个苏氨酸和4个酪氨酸;无信号肽和跨膜螺旋结构,亚细胞定位显示,主要存在于细胞核中,属于非分泌型蛋白;蛋白高级结构主要由39.06%的α-螺旋和56.25%的无规则卷曲结构组成。同源性分析比对牦牛与普通牛亲缘关系最近,符合实际情况,说明Akirin1基因在进化过程中相对具有一定保守性。实时荧光定量结果显示,Akirin1基因在成年甘南牦牛心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪组织均有所表达,而在肾脏组织中相对表达最多,显著高于其他组织,在肌肉和肝脏组织中表达相对较少。本试验为进一步研究牦牛Akirin1基因功能特征提供一定的理论基础。

来源：2024年第S1期

《华北农学报》期刊编辑部

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