华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2024年第6期:牦牛PID1基因克隆、生物信息学及组织表达分析

发布日期:

作者:余道宁, 王佟, 洛桑顿珠, 平措占堆, 张强, 卓玛次仁, 尼玛加措, 张德荣, 梁春年

单位:1 西北民族大学 生命科学与工程学院,甘肃 兰州 730124;2 中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育重点实验室,甘肃 兰州 730050;3 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室,甘肃 兰州 730050;4 西藏自治区农牧科学院 畜牧兽医研究所,西藏 拉萨 850004;5 日喀则市昂仁县农业农村局,西藏 日喀则 857001

关键词:牦牛,<i>PID1</i>基因,基因克隆,生物信息学,

基金:西藏自治区区域科技协同创新项目(QYXTZX-RKZ2022-03); 国家重点研发计划项目(2022YFD1302101); 现代肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37)

为研究牦牛磷酸酪氨酸互作结构域1基因(PID1)的结构及功能,并探究其在各组织中的表达情况,以桑桑牦牛脂肪组织cDNA为模板克隆桑桑牦牛PID1基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析。同时,采用实时荧光定量PCR方法(RT-qPCR),对牦牛的7个不同组织包括心、肝、脾、肺、肾、背部肌肉及脂肪进行PID1基因表达水平的定量。结果表明,牦牛PID1基因的编码区长度是654 bp,编码217个氨基酸;通过同源性比对,结果发现,牦牛与野牦牛之间的亲缘关系最为接近,相似度达到100%;经过蛋白质分析发现,牦牛PID1蛋白的分子质量约为24.84 ku,理论等电点为6.30。根据不稳定系数计算结果显示,其不稳定性较高(47.96),属于一种不稳定蛋白质。该蛋白内含有1个N-糖基化位点和23个磷酸化位点,无信号肽和跨膜结构。RT-qPCR试验结果表明,在各个组织中都能检测到PID1基因的表达情况,其中在肺部表达量最高。该研究克隆了牦牛PID1基因,并对其蛋白结构进行了分析,同时还研究了该基因在牦牛组织中的表达情况。为进一步探究PID1基因在牦牛脂肪沉积过程中的作用提供了初步数据。

来源:2024年第6期

《华北农学报》期刊编辑部

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