华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2024年第5期:基于转录组信息的辣椒MADS-box转录因子家族分析

发布日期:

作者:丁楚琦, 吴鹏, 郭茜茜, 王丽, 郭展新, 冯柏龙

单位:齐齐哈尔大学 生命科学与农林学院,抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室,黑龙江 齐齐哈尔 161006

关键词:辣椒,MADS-box,转录因子,次生代谢,

基金:黑龙江省省属本科高校基本科研业务费科研项目(145209143); 黑龙江省省属本科高校基本科研业务费科研项目(YSTSXK201889); 齐齐哈尔大学2023年校级“课程思政”示范课程培育项目; 齐齐哈尔大学教育科学研究项目(GJQTZX-202242); 齐齐哈尔大学大学生创新创业项目(202220232133); 齐齐哈尔大学大学生创新创业项目(202220232337)

MADS-box转录因子广泛存在于植物中,在生长发育和次生代谢过程中发挥重要作用。为探究MADS-box转录因子家族在辣椒素不同积累时期的表达情况。利用辣椒素不同积累时期转录组数据,鉴定辣椒MADS-box转录因子家族成员,并进行亚细胞定位、保守基序、系统进化树和染色体定位分析,对其功能进行初步分析。结果表明,在辣椒转录组数据中共鉴定出95个MADS-box转录因子;含有105~395个氨基酸;分子质量为11.55~44.46 ku;理论等电点为5.16~10.01;主要在细胞核表达,均含有MADS 保守结构域,系统发育分析表明,MADS蛋白可分为8个亚家族。有73条CaMADS家族成员定位到12条染色体上。差异表达的MADS-box基因有26个,其中6个基因在C1 vs C2时期上调,在C2 vs C3时期下调。基于KEGG富集和蛋白互作预测到CaMADS13可能参与辣椒中木质素的合成。CaMADS24可能参与辣椒素和木质素合成前体香豆酰辅酶A的合成。利用生物信息学分析,鉴定了辣椒MADS-box家族转录因子,为深入研究辣椒素次生代谢中的分子调控机制提供理论基础。

来源:2024年第5期

《华北农学报》期刊编辑部

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