华北农学报

作者：张敬敬, 田鹏, 于洪春, 李冰, 高秀瑞, 刘伟, 吴楠, 赵鑫泽, 宋雪, 刘会茹, 潘秀清, 武彦荣

单位：1 河北省农林科学院 经济作物研究所,河北 石家庄 050051；2 河北省扶贫开发协会秘书处,河北 石家庄 050051

关键词：西瓜,果皮硬度,基因组测序,转录组测序,候选基因,

基金：河北省人社厅高层次人才资助“三三三人才工程资助”项目(C20221134); 河北省农林科学院现代农业科技创新专项课题(2022KJCXZX-JZS-2); 财政部和农业农村部国家现代农业西甜瓜产业技术体系项目(CARS-25-Z19); 河北省省级科技计划西甜瓜现代种业科技创新团队(21326306D)

为了挖掘西瓜果皮硬度关键调控基因,选育耐裂高硬度果皮西瓜品种。以西瓜果皮硬度差异显著的高硬度材料901和低硬度材料BSH为亲本,构建F2分离群体,采用极端性状混池重测序接合BSA(BSA-seq)方法进行定位,并结合转录组测序(RNA-seq)数据进行关联分析,挖掘果皮硬度关键调控基因。BSA-seq结果表明,SNPs和InDels关联区域交集位于10号染色体1 620 000-3 760 000 bp区间内共2.14 Mb的区段,包含150个候选基因,其中2个非同义突变基因和1个移码突变基因。将BSA-seq测序结果与RNA-seq测序结果进行联合分析发现,共有Cla97C10G187120、Cla97C10G187020、Cla97C10G187430、Cla97C10G187510、Cla97C10G187280和Cla97C10G186540 6个基因相关联,经生物信息学分析,确定Cla97C10G187120基因为西瓜果皮硬度候选基因。实时荧光定量(qRT-PCR)试验结果表明,转录组试验数据可靠,并且候选基因Cla97C10G187120在901中表达较BSH明显降低。本研究为进一步精细定位西瓜果皮硬度调控基因奠定了基础。

来源：2024年第5期

《华北农学报》期刊编辑部

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