华北农学报

作者：申金伟, 路建卫, 赵雪, 扎老, 成述儒, 梁春年

单位：1 中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,甘肃 兰州 730050；2 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室,甘肃 兰州 730050；3 甘肃农业大学,甘肃 兰州 730124；4 合作市佐盖多玛乡畜牧站,甘肃 合作 747000；5 合作市农畜产品质量安全检测检验中心,甘肃 合作 747000

关键词：美仁牦牛,<i>DJ</i>-<i>1</i>基因,生物信息学分析,系统进化,

基金：合作市牦牛种质提升与提质增效项目; 现代肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37); 甘肃省基础研究创新群体项目(20JR5RA580); 甘肃省科技重大专项(21ZD10NA001); 甘肃省科技重大专项(GZGG-2021-1); 中国农业科学院创新工程(25-LIHPS-01)

为了研究牦牛DJ-1基因的结构及功能,为后续深入研究牦牛DJ-1基因的生物学功能提供了重要的理论依据。以美仁牦牛脂肪组织cDNA为模板,利用RT-PCR克隆牦牛DJ-1基因的编码区序列(CDS ),并且利用基因序列进行生物信息学分析,预测结构域及蛋白质理化性质等,再利用RT-qPCR技术进行组织表达分析。结果表明,美仁牦牛DJ-1基因的CDS区全长570 bp,共编码189个氨基酸;牦牛DJ-1结构域预测显示,在DJ-1氨基酸序列的29—168 位中有1个含有Pfam的PfpI结构域;通过对DJ-1蛋白结构和功能进行预测,结果显示,无跨膜结构且无信号肽区域,分子质量20.035 31 ku,原子总数2 870,理论等电点6.84,不稳定系数28.37,表示为稳定的蛋白质;脂肪系数101.11,总平均亲水系数-0.004,为亲水蛋白,共有11个磷酸化位点;同时,亚细胞定位预测结果表明,美仁牦牛DJ-1蛋白主要分布于细胞质和线粒体中,系统进化树表明,美仁牦牛与野牦牛和欧洲牛亲缘关系最近,与北极狐和宽吻海牛亲缘关系最远;RT-qPCR结果表明,在成年美仁牦牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中均有所表达,在心脏组织和肌肉组织中表达水平最高,在肝脏和睾丸组织中表达水平最低。

来源：2024年第2期

《华北农学报》期刊编辑部

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