华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2024年第1期:工业大麻HD-Zip基因家族鉴定与干旱胁迫下的表达分析

发布日期:

作者:葛雯冬, 王腾辉, 高美玲, 范震宇, 王玉书

单位:1 齐齐哈尔大学 生命科学与农林学院,黑龙江 齐齐哈尔 161006;2 齐齐哈尔大学,寒区麻及制品教育部工程研究中心,黑龙江 齐齐哈尔 161006

关键词:大麻,HD-Zip基因,干旱胁迫,表达分析,

基金:黑龙江省教育厅基本科研业务专项(145209513); 齐齐哈尔大学创新创业训练计划项目(S202210232004X)

HD-Zip在植物抗逆过程中起着重要的调节作用,为了解大麻基因组中HD-Zip基因家族的特征和潜在功能,并为进一步研究CsHDZ基因对干旱胁迫下的调控提供重要线索,根据大麻全基因组数据库中的参考序列,利用生物信息学的方法对大麻HD-Zip基因家族进行全基因组鉴定,并系统分析其理化特性、进化发育、基因结构、启动子顺式结合元件并测定干旱胁迫下的表达模式。结果表明,大麻HD-Zip基因家族共筛选出20个CsHDZs基因,分别定位在7条染色体上,属于4个亚家族,编码氨基酸204 ~ 837 个,理论等电点4.54~9.04,属不稳定蛋白,亚细胞定位预测全部定位于细胞核;蛋白保守基序分析显示,CsHDZs共有10个保守基序,其中motif 1和motif 9为各成员共有;启动子调控元件分析发现,CsHDZs富含多种逆境胁迫应答相关元件。实时荧光定量分析结果显示,CsHDZ1/8/10基因转录水平在干旱前期无显著差异,而后期显著上调。研究表明CsHDZs基因参与了胁迫应答过程并能够积极响应干旱。

来源:2024年第1期

《华北农学报》期刊编辑部

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