华北农学报

作者：刘礼瑶, 熊仁次, 何璐, 马思洁, 杨叔青

单位：1 塔里木大学 农学院,新疆 阿拉尔 843300；2 南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室,新疆 阿拉尔 843300；3 塔里木大学 园艺与林学学院,新疆 阿拉尔 843300

关键词：蔷薇科,小G蛋白ROP,全基因组筛查,Rho功能域,系统进化关系,蛋白理化特征,

基金：国家自然科学基金项目(32160644); 塔里木大学校长基金项目(TDZKBS202101)

为全面系统地挖掘蔷薇科小G蛋白ROP,在分子水平上为蔷薇科抗病育种提供候选基因。物种系统进化关系分析、ROP蛋白全基因组筛查、Rho功能域分析、蛋白聚类分析及理化性质分析分别运用了NCBI、iTOLv6、GDR、SMART、MEGA 11.0和Maximum-likelihood algorithm1及Protparam和Expasy等数据库及生物信息学在线软件。11种蔷薇科植物聚为6个亚支;11种蔷薇科植物中筛查到80个ROP 蛋白;80个蔷薇科ROP蛋白和11个拟南芥ROP蛋白聚为6个进化分支;蛋白长度、等电点、分子量、脂肪指数及不稳定指数分别为143~215 aa、5.59~9.63、15.735 99~23.878 59 ku、85.28~94.95和27.96~57.14。80个蔷薇科ROP蛋白在草莓中数量最多,甜樱桃最少;蔷薇科ROP蛋白分布于第Ⅳ、Ⅴ和Ⅵ分支中,拟南芥ROP蛋白分布于Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ分支中,即分支Ⅵ为蔷薇科特异性分支,分支Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ为拟南芥特异性分支。

来源：2023年第S1期

《华北农学报》期刊编辑部

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