华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2023年第5期:观赏辣椒ARP基因克隆及表达分析

发布日期:

作者:黄渺, 罗悠悠, 倪芮, 肇瑾

单位:贵州大学 农学院,贵州 贵阳 550025

关键词:观赏辣椒,<i>CfARP</i>,基因克隆,生物信息学分析,qRT-PCR,低温胁迫,

基金:国家自然科学基金地区基金(32260799); 贵州省生物学国内一流学科建设学科开放基金(GNYL(2017)009FX4KT41); 贵州省科技厅一般基金项目(黔科合基础[2021]1Y1121); 贵州大学培育项目(贵大培育[2019]42号)

为研究ARP在观赏辣椒低温胁迫下的响应情况,旨在为后续观赏辣椒低温下基因功能研究提供理论基础。通过RT-PCR技术从观赏辣椒中克隆得到与辣椒、番茄、马铃薯的同源ARP基因,命名为CfARP,分析其在观赏辣椒不同组织以及低温处理下的表达情况;通过利用生物信息学分析进行基因蛋白编码情况、理化性质、基因亲缘关系研究,并利用qRT-PCR技术检测CfARP在观赏辣椒不同组织以及低温处理下的表达量。结果表明,CfARP基因CDS序列为342 bp,与辣椒(遵辣1号)同源性为100%,可编码113个氨基酸,含有一个保守的Auxin-repressed结构域;蛋白理化分析发现,CfARP蛋白分子量为12.156 ku,等电点为10.22,亲水性平均系数为-0.913,初步预测CfARP为亲水性蛋白;与其他物种ARP氨基酸序列对比发现,CfARP在茄科植物中高度保守。实时荧光定量PCR结果显示,CfARP基因在观赏辣椒茎中表达量最高,根中次之,叶和花中相对较少;CfARP基因的表达量随着低温处理时长的增加而不断升高。初步推测CfARP在观赏辣椒响应低温胁迫过程中具有一定作用。

来源:2023年第5期

《华北农学报》期刊编辑部

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