华北农学报

作者：白璐, 辛翠花, 刘乐乐, 王俊杰, 简磊, 邵玉涛, 裴海霞, 郭江波

单位：内蒙古科技大学 生命科学与技术学院,内蒙古 包头 014010

关键词：本氏烟草,<i>NbEHD1</i>,生物信息学分析,CRISPR/Cas9,

基金：内蒙古自然科学基金项目(2022LHMS03013); 国家自然科学基金项目(32060498)

为了研究本氏烟草NbEHD1基因的生物学功能,采用生物信息学方法对其基因结构、蛋白保守结构域、磷酸化位点、亚细胞定位及进化关系等多个方面进行预测。结果表明,本氏烟草NbEHD1编码序列全长1 638 bp,其基因组序列包含16个外显子和15个内含子。NbEHD1蛋白大概率定位于细胞质中,无信号肽,无跨膜区,蛋白序列有42个磷酸化位点。NbEHD1属于P-loop_NTPase超家族,具有EHD家族特有保守结构域。系统进化关系结果表明,本氏烟草NbEHD1与马铃薯、番茄的EHD序列亲缘关系较近。经与SGN数据库中本氏烟草测序数据比对,获得NbEHD1预测的全序列并设计基因特异性引物,扩增得到其序列全长。在获得NbEHD1 CRISPR/Cas9基因编辑载体后,采用农杆菌介导的方法,将此载体成功转化到本氏烟草叶片,经鉴定成功获得T0阳性植株16株,为进一步确定NbEHD1基因的生物学功能提供了研究材料。

来源：2023年第5期

《华北农学报》期刊编辑部

查看华北农学报杂志2023年第5期