华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2023年第5期:利用SRAP分子标记分析谷瘟病菌遗传多样性

发布日期:

作者:刘佳, 张梦雅, 任世龙, 王永芳, 马继芳, 全建章, 刘磊, 董志平, 白辉, 李志勇

单位:河北省农林科学院 谷子研究所,河北省杂粮重点实验室,农业农村部特色杂粮遗传改良与利用重点实验室(部省共建),河北 石家庄 050035

关键词:谷子,谷瘟病菌,SRAP,相似性系数,遗传多样性,

基金:河北省自然科学基金(C2021301062); 河北省农林科学院基本业务费(2021030201); 河北省重点研发计划项目(21326338D); 河北省农林科学院基本科研业务费包干制项目(HBNKY-BGZ-02); 国家谷子高粱产业技术体系(CARS-06-14.5-A25)

了解谷瘟病菌的变异和群体结构,为今后谷瘟病的防控及抗病品种培育提供理论基础。利用20对SRAP引物对采自9个地区的90株谷瘟病菌菌株进行了PCR扩增,利用NTSYSpc-2.11F软件进行数据分析,通过UPGMA方法进行聚类分析,使用Popgene 32软件计算各群体间的遗传多样性指数。结果表明,筛选出了8对引物用于谷瘟病菌的遗传多态性分析,这8对引物共扩增出条带1 728条,其中多态性条带1 492条,多态性比率为86.34%。对90株病原菌进行聚类分析,其相似性系数为0.77~0.85,遗传相似系数为0.802时,所有菌株被分为27个遗传宗谱(L1~L27),其中L1为绝对优势组群,共包含来自山东、河北、山西、河南和辽宁5个省份的29株谷瘟病菌,占总菌株的32.22%。经Popgene 32软件计算分析,9个地区谷瘟病菌的Nei's遗传多样性指数(H)为0.141 4~0.288 1,Shannon's信息指数(I)为0.196 0~0.441 6,河北夏谷区Nei's遗传多样性指数和Shannon's信息指数最高,遗传多样性最丰富,而海南群体遗传多样性最低。对不同地区谷瘟病菌群体比较,吉林群体与海南群体的遗传亲缘关系最远,而河北夏谷区群体与河北春谷区群体的亲缘关系最近。可见,不同地区谷瘟病菌的遗传多样性丰富,各菌株间存在遗传分化,但菌株间的遗传分化与地理来源无明显相关性。

来源:2023年第5期

《华北农学报》期刊编辑部

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