华北农学报

作者：杨国武, 王佟, 马小勇, 扎老, 路建卫, 赵雪, 阎萍, 梁春年

单位：1 西北民族大学 生命科学与工程学院,甘肃 兰州 730124；2 中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育工程重点实验室, 甘肃 兰州 730050；3 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室,甘肃 兰州 730050；4 合作市佐盖多玛乡畜牧站, 甘肃 合作 747000；5 合作市农畜产品质量安全检测检验中心,甘肃 合作 747000

关键词：美仁牦牛,PHB基因,克隆,生物信息学,表达谱,

基金：国家重点研发计划(2021YFD1600200); 甘肃省基础研究创新群体项目(20JR5RA580); 合作市牦牛种质提升与提质增效项目; 牦牛现代肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37); 中国农业科学院创新工程(25-LIHPS-01); 甘肃省科技重大专项(21ZD10NA001); 甘肃省科技重大专项(GZGG-2021-1)

为研究美仁牦牛抗增殖蛋白(PHB)的结构及功能,并探究其在7日龄牛和成年牛的各组织中的表达情况。以美仁牦牛肾脏组织cDNA为模板克隆美仁牦牛PHB基因序列。对基因序列进行生物信息学分析以及对蛋白质进行理化性质预测,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测PHB基因在美仁牦牛2个年龄段8个组织中的相对表达量。结果表明,美仁牦牛PHB基因的CDS区全长819 bp,共编码272个氨基酸;同源性比对发现美仁牦牛与普通牛的同源性最高(99.1%);美仁牦牛PHB蛋白分析显示,PHB蛋白内存在1个N-糖基化潜在位点和2个O-糖基化潜在位点,其氨基酸等电点为5.55,不稳定系数(Ⅱ)为46.07,总平均疏水性为0.045,预测为不稳定疏水性蛋白质;亚细胞定位显示,PHB蛋白位于线粒体(30.4%),蛋白内共有潜在磷酸化位点15个,PHB蛋白高级结构由α-螺旋(56.25%)、无规则卷曲(22.43%)、延伸链(16.54%)和β-转角(4.78%)相互连接而成。RT-qPCR结果显示,美仁牦牛2个发育阶段的8个组织中均有PHB基因的表达。在对比2个时期的PHB基因组织表达规律后发现,7个组织的PHB基因表达量随美仁牦牛的生长发育而降低,在美仁牦牛肝脏、脾脏、肺脏、脂肪和睾丸组织中,PHB基因表达量随年龄显著降低(P<0.05)。

来源：2023年第5期

《华北农学报》期刊编辑部

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