华北农学报

作者：贾羽晴, 夏晶晶, 薛百玲, 税斐, 曹程程, 丁元飞, 张泰康, 耿照玉, 金四华

单位：安徽农业大学 动物科技学院,安徽 合肥 230036

关键词：鸡,<i>ITGB1</i>基因,生物信息学分析,同源性,

基金：国家自然科学基金项目(31802028); 安徽高校优秀青年人才支持重点项目(gxyqZD2022017); 安徽省教育厅高校自然科学研究重点项目(2022AH050928); 广东省动物分子设计与精准育种实验室开放课题(2019B01); 安徽省重点研究与开发计划项目(202004a06020049)

利用生物信息学方法分析鸡ITGB1基因结构及其编码蛋白理化性质,结构位点及细胞定位等,旨在进一步探究该基因功能与潜在用途。同时从GenBank中下载鸡、鹅、鸭、火鸡、人、猪、兔、小鼠、大鼠、绵羊、黑猩猩11个物种的ITGB1基因CDS序列为材料,对该11个物种的ITGB1蛋白序列进行同源性和系统进化分析。结果表明,该基因CDS区长度为2 412 bp,共编码803个氨基酸,其相对分子质量为88 618.48,理论等电点为5.14;其是一个亲水性的稳定蛋白,有信号肽;蛋白二级结构上,含有162个α-螺旋, 459个无规则卷曲,182伸展条和一个跨膜结构。鸡ITGB1基因的编码蛋白经同源性比对,发现其与鹅、火鸡、鸭的ITGB1蛋白高度同源。利用生物信息学方法对ITGB1基因及其表达的蛋白进行研究,有助于理解该基因在鸡这一物种上的相关作用,为进一步开发利用鸡ITGB1基因进行禽业生产、禽病防控以及分子育种提供了参考依据。

来源：2022年第S1期

《华北农学报》期刊编辑部

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