华北农学报

作者：吉颖, 孙枫, 吴淑华, 李硕, 涂丽琴, 高丹娜, 崔晓艳, 陈新, 季英华, 郭青云

单位：1.青海大学 农林科学院,青海省农业有害生物综合治理重点实验室,农业部西宁作物有害生物科学观测实验站,青海 西宁 810016；2.江苏省农业科学院 植物保护研究所,江苏 南京 210014；3.江苏省农业科学院 经济作物研究所,江苏 南京 210014

关键词：大豆,豇豆轻斑驳病毒,全基因组序列,克隆,特征分析,

基金：国家自然科学基金项目(32072506); 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-24-C-01); 国家现代农业产业技术体系建设专项(1011); 青海省农业有害生物综合治理重点实验室(2021-ZJ-Y08)

为明确豇豆轻斑驳病毒江苏分离物的基因组结构特征,阐明其分类地位及进化特点,选择采自江苏的CpMMV大豆分离物作为研究对象,针对病毒基因组序列设计了4对特异性引物,以病样总RNA反转录后获得的cDNA为模板,通过分段法对其基因组序列片段进行了PCR扩增,扩增产物克隆至T载体经验证后进行序列测定,获得的序列片段经拼接组装得到病毒全基因组序列。序列分析结果显示,CpMMV江苏分离物基因组核苷酸序列全长8 194 bp,编码6个蛋白,5'端和3'端各含有一个非编码区(UTR),长度分别为72,117 nt;在编码的6个蛋白中,CP与其他分离物之间的同源性较高(96.5%~100.0%),相对保守;而RdRp(81.1%~98.2%)、TGB1(81.0%~97.0%)、TGB3(80.9%~95.6%)同源性相对较低,在不同分离物中表现较好的多样性;基于全基因组序列的系统进化分析结果显示,江苏分离物与已公开的其他CpMMV分离物同源性较高,共同聚类到一个大分支上,其中与中国安徽分离物同源性最高(98.2%),与海南分离物次之(96.0%),而与美国、巴西、印度、墨西哥、肯尼亚等国外分离物同源性相对较低(<82.7%)。这些研究结果表明,CpMMV江苏分离物与其他CpMMV分离物具有类似的基因组结构特征,在系统进化上,江苏分离物与国内分离物近缘而与国外分离物远缘。

来源：2022年第3期

《华北农学报》期刊编辑部

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