该杂志刊期列表
- 2026年
- 1期
国内刊号:13-1101/S
国际刊号:1000-7091
发布日期:
作者:崔彦芹, 郭元章, 侯少锋, 李思达, 关中波, 徐桂真
单位:河北省农林科学院 粮油作物研究所, 河北省作物遗传育种实验室, 河北 石家庄 050035
关键词:芝麻,株高,混池测序,候选基因,
基金:国家特色油料产业技术体系(CARS-14-2-01);河北省省级科技计划——现代种业科技专项(19226349D);河北省农林科学院创新工程(2019-4-3-4)
为了进一步挖掘芝麻株高相关基因,为适机收芝麻新品种选育提供理论指导,以冀航芝1号和DW607为亲本构建F2群体,并构建以株高为目标性状的极端混池,利用BSA-seq技术,采用ED和Δ(SNP-index或InDel-index)2种方法挖掘株高相关的染色体区段,注释区段内的基因信息,利用GO和KEGG等数据库分析注释基因的功能。结果发现,亲本之间共获得298 634个SNP和76 360个InDel,混池之间共获得24 048个SNP和9 630个InDel;基于SNP标记的ED方法关联到5个染色体区段,ΔSNP-index方法关联到3个染色体区段,两者的交集有3个;基于InDel标记的ED方法关联到5个染色体区段,ΔInDel-index方法关联到8个染色体区段,两者的交集有8个;4个染色体区段同时被SNP和InDel标记关联到,共注释到330个基因,比对到的前20个KEGG通路主要包括植物激素信号转导和能量代谢;GO富集结果表明,有18个基因参与生长素响应,可能是参与株高调控的关键基因。
来源:2021年第S1期
《华北农学报》期刊编辑部