华北农学报

作者：高倩, 冯燕, 杨雅华, 赵青松, 雷雅坤, 刘兵强, 张孟臣, 史晓蕾, 杨春燕

单位：1. 河北省农林科学院 粮油作物研究所, 国家大豆改良中心石家庄分中心, 农业农村部黄淮海大豆生物学与遗传育种重点实验室, 河北省作物遗传育种实验室, 河北 石家庄 050035;；2. 河北省农林科学院, 河北 石家庄 050035;；3. 河北省农林科学院 滨海农业研究所, 河北 唐海 063202;；4. 河北省农林科学院 农业信息与经济研究所, 河北 石家庄 050051

关键词：野生大豆,蛋白含量,关联分析,SNP,单倍型,

基金：国家自然科学基金项目（31871652）；河北省重点研发计划现代种业科技专项（19226356D）；河北省高层次人才资助项目（A201802010）；河北省农林科学院基本科研业务费项目（2018060301）；河北省农林科学院创新工程项目（2019-4-3-1）；国家大豆产业技术体系（CARS-04）；河北省现代种业科技创新专项（21326313D）

为了充分挖掘野生大豆种质资源中的高蛋白基因及其连锁标记，以来自中国、韩国和日本，涵盖第4，5，6，7，8熟期组的508份野生大豆种质资源为材料，通过全基因组关联分析挖掘与野生大豆中高蛋白基因相关的SNP。参试材料蛋白含量数据从美国农业部种质资源信息网下载，为2 a利用凯氏定氮法测定蛋白含量数据平均值，基因型数据从Soybase网站下载，利用Illumina公司大豆50K芯片（SoySNP50K BeadChip含有52 041个SNP标记）检测获得。结果表明，参试材料蛋白含量呈正态分布，介于38.1%~56.9%，平均48.1%，标准差2.71%。遗传结构分析将参试材料划分为3组，分别包含271，111，126份材料。基于混合线性模型的关联分析，共检测到与蛋白含量相关的SNP位点74个，散布在19条染色体的60个单倍型区段内。显著性SNP位点LOD平均值为3.47，SNP位点BARC_1.01_Gm_01_54656209_A_G的LOD值最大，为5.18。根据显著性SNP位点富集程度，确定第11号染色体常染色质区15 128 832~15 253 199 bp、第12号染色体异染色质区26 842 687~27 818 244 bp的单倍型区段为本研究中的2个蛋白含量显著性相关区段，命名为HAP_11_1和HAP_12_1。HAP_11_1中，SNP位点BARC_1.01_Gm_11_15167305_G_A的LOD值最大，为3.80，可解释遗传变异为2.88%。HAP_12_1中，SNP位点BARC_1.01_Gm_12_27563620_C_T的LOD值最大，为4.12，可解释遗传变异为3.23%。为野生大豆高蛋白基因育种利用提供了检测标记，为野生大豆高蛋白基因克隆提供了线索。

来源：2021年第S1期

《华北农学报》期刊编辑部

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