华北农学报

作者：翟玲侠, 于崧, 侯玉龙, 秦猛, 朱雪天, 王小琴, 于立河

单位：1. 黑龙江八一农垦大学 农学院, 黑龙江 大庆 163319;；2. 黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室, 黑龙江 大庆 163319

关键词：芸豆,NAC转录因子,生物信息学,盐碱胁迫,

基金：国家重点研发计划课题（2018YFD1000704）；黑龙江省博士后面上基金项目（LBH-Z19195）；黑龙江八一农垦大学研究生创新科研项目（YJSCX2021-Y48）

为进一步揭示芸豆NAC基因在参与调控植物生长发育及应对非生物胁迫反应中的作用，以芸豆耐盐碱品种HYD为试验材料，利用Illumina HiSeq技术，构建了NaHCO3处理和NaCl处理下的芸豆叶片组织转录组。从转录组数据中共筛选出8个盐碱相关NAC转录因子，并对其进行理化性质分析、系统进化发育分析、磷酸化位点预测、蛋白质二级结构预测、启动子元件分析、基因结构分析、染色体定位分析和表达量分析。结果表明：8个芸豆盐碱响应NAC基因分子量在23 676.36~44 354.33 ku，蛋白编码203~394个氨基酸，等电点在4.74~8.86，其中3个基因编码酸性蛋白，8个蛋白被分为4个亚族（a~d），分列在8个染色体上，包含3个膜结合蛋白，8个蛋白中丝氨酸数量最多，有10~22个，无规则卷曲结构占比最大，在68.0%~84.5%，8个蛋白全部定位在细胞核上。在NaHCO3处理下，4个基因为上调表达（log2FC>2），2个为下调表达（log2FC<-2），NaCl处理下，1个为上调表达（log2FC>2），4个为下调表达（log2FC<-2），有3个基因同时响应NaHCO3和NaCl。在8个基因启动子中共发现10个启动子元件，同时每个基因都包含3~7个元件。表明这些基因都可能参与芸豆的逆境应答。

来源：2021年第6期

《华北农学报》期刊编辑部

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