华北农学报

作者：喻锦莉, 刘长爱, 符霖, 王鑫, 欧阳解秀

单位：南昌大学 生命科学学院, 江西省分子生物学与基因工程重点实验室, 江西 南昌 330031

关键词：水稻,热激蛋白,<i>OsHSP40</i>,可变剪接,表达分析,

基金：国家自然科学基金项目（31960422）；南昌大学研究生创新专项资金（CX2019108）；江西省研究生创新专项资金（YC2016-S063）

综合运用生物信息学、RT-PCR和TA克隆技术对水稻热激蛋白基因OsHSP40的可变剪接体进行鉴定，并分析剪接体的表达。首先，利用生物信息学分析发现，该基因存在4种可变剪接体。根据不同可变剪接体的序列信息设计特异性引物进行RT-PCR扩增，结合TA克隆，成功鉴定到OsHSP40的4种可变剪接体。随后，提取野生型植株的根、茎、叶、幼穗和不同发育时期的籽粒，进行不同组织部位的表达分析，RT-PCR结果显示：可变剪接体4（OsHsp40.4）与OsHsp40.1234在不同组织部位的表达模式存在差异。最后，分析在高盐和高温条件下不同剪接本的表达，结果发现，高盐条件下OsHsp40.4和OsHsp40.1234表达上升，但OsHsp40.4上升幅度较低；高温处理后，OsHsp40.1234在处理后2 h表达变化不显著，处理后4 h其表达显著上升，而OsHsp40.4则在处理后2 h表达显著上升。综上，成功鉴定到OsHSP40基因的4种可变剪接体，发现可变剪接体OsHsp40.4和OsHsp40.1234在高盐和高温胁迫过程中的表达存在差异。上述结果为进一步研究该基因的生物学功能奠定基础。

来源：2021年第3期

《华北农学报》期刊编辑部

查看华北农学报杂志2021年第3期