华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2021年第3期:猪ATP6V0A4基因启动子核心区的筛选与分析

发布日期:

作者:汪亮, 李忠秋, 唐晓东, 张海峰, 刘娣, 张冬杰

单位:1. 黑龙江省农业科学院, 黑龙江 哈尔滨 150086;;2. 农业农村部种养结合重点实验室, 黑龙江 哈尔滨 150086

关键词:猪,<i>ATP6V0A4</i>,启动子,核心区,双荧光素酶报告系统,

基金:黑龙江省杰出青年基金项目(JQ2020C005);黑龙江省博士后基金资助项目(LBH-Z18263)

ATP6V0A4基因编码V-ATP酶的一个亚基,与H+转运相关,是遗传性远端肾小管性酸中毒的致病基因。在前期研究中发现,民猪在遭受冷应激后其背脂中ATP6V0A4基因的转录水平发生了显著上升(P<0.05)。为了分析ATP6V0A4基因在转录水平的调控机制,构建了一系列长度不同的含有该基因5'端启动子区域的双荧光素酶报告基因质粒,转染PK15细胞并检测双荧光素酶的相对活性。根据检测结果,利用重叠PCR技术定点靶序列,预判可能存在的转录调控因子。结果发现,该基因启动子区的-1 504~-1 bp片段具有转录活性,通过2轮启动子截短试验后判定-265~-1 bp区域内存在正调控元件,-581~-265 bp区域内存在负调控元件。定向缺失-205~-190 bp,-120~-110 bp小片段后,确定-205~-190 bp区域内存在调控该基因转录的正调控元件结合位点,通过在线软件预测后发现E2F3、SP2、EGR1、E2F6、CTCFL、E2F1、SP1和ETF可能是该基因的正调控转录因子。首次克隆了猪的ATP6V0A4基因的启动子区域并进行了转录因子结合位点的筛选与鉴定,为后续研究其在冷应激状态下的转录调控奠定了基础。

来源:2021年第3期

《华北农学报》期刊编辑部

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