华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2021年第2期:铝处理下绣球实时荧光定量PCR内参基因筛选及验证

发布日期:

作者:陈双双, 齐香玉, 冯景, 陈慧杰, 王华娣, 秦紫艺, 邓衍明

单位:1. 江苏省农业科学院 休闲农业研究所, 江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室, 江苏 南京 210014;;2. 江苏大学 生命科学学院, 江苏 镇江 212013;;3. 南京农业大学 园艺学院, 江苏 南京 210014

关键词:绣球,铝处理,内参基因,表达稳定性,

基金:国家自然科学基金项目(31901359);江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划项目(ZX(17)2004);江苏省昆山市科技项目(KN1809)

为筛选适合铝处理下绣球中稳定表达的内参基因,在转录组数据分析的基础上,以Al2(SO4)3处理下绣球铝敏感品种Bailer(商品名:Endless SummerTM,中文名译为无尽夏)和不敏感品种Ruby(中文名译为红宝石)的不同组织为材料,分析10个候选内参基因(5个传统内参基因和5个新基因)的表达水平,并利用geNorm、NormFinder、BestKeeper、ΔCt及RefFinder 5个程序分析候选内参基因的表达稳定性。结果表明,β-TUB(β-微管蛋白)和UPL7(E3泛素蛋白连接酶)的表达水平较高,而且相对较稳定;表达稳定性分析结果显示,在Al2(SO4)3处理下Bailer中最适内参基因为UPL7和β-TUB,其次是ACT7,Ruby中最适内参基因为β-TUB和UBP15,其次是UPL7;适用于不同组织器官以及所有样本的最适内参基因同样为β-TUB、UBP15和UPL7。因此,β-TUB和UPL7为铝处理下绣球实时荧光定量PCR最适内参基因;以β-TUB、UPL7和β-TUB+UPL7作为内参基因时,绣球铝转运蛋白基因HmVALT的表达模式一致。

来源:2021年第2期

《华北农学报》期刊编辑部

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