华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2020年第6期:茉莉花实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证

发布日期:

作者:齐香玉, 陈双双, 冯景, 王华娣, 邓衍明

单位:1. 江苏省农业科学院 休闲农业研究所, 江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室, 江苏 南京 210014;;2. 江苏大学 生命科学学院, 江苏 镇江 212013

关键词:茉莉花,qRT-PCR,内参基因,表达稳定性,

基金:国家自然科学基金项目(31772338)

为筛选适合茉莉花的内参基因,以5种组织(根、茎、嫩叶、成熟叶、花)和4个发育阶段的花(幼蕾期、膨大花蕾期、最长花蕾期和初绽期)为试验材料,选择较常见的8个候选内参基因进行引物特异性分析,结果显示,8个内参基因均扩增出单一条带,溶解曲线均只有明显的单一峰。采用qRT-PCR技术分析8个内参基因在不同样品中的表达量,结果显示,内参基因在不同样品中的表达量存在差异,各基因在花中的表达量均显著低于其他样品。利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件对基因的表达稳定性进行评价,并通过RefFinder对表达稳定性进行综合分析,结果表明,适用于不同组织(有花组)的最优内参基因为SAND和UPL7;适用于不同组织(无花组)的最优内参基因为UPL7和GAPDH;而适宜不同发育阶段花的最优内参基因为Actin和EF1α。进一步利用JsDXS和JsPAL2对筛选的内参基因进行验证,结果显示,以稳定性好的Actin、EF1α及Actin+EF1α<组合为参照时,JsDXS和JsPAL2在花发育不同阶段的表达水平的变化趋势基本一致,而用最不稳定的PP2A为参照时,花发育不同阶段的表达水平的变化趋势不一致。总之,本研究对茉莉花内参基因进行了筛选,不同组织(有花组)的最优内参基因为SAND和UPL7;不同组织(无花组)的最优内参基因为UPL7和GAPDH;花发育不同阶段的最优内参基因为Actin和EF1α。

来源:2020年第6期

《华北农学报》期刊编辑部

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