华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2020年第5期:水稻OsURGT1基因的生物信息学及表达谱分析

发布日期:

作者:苏莹, 杜强, 郭崇炎, 周敏, 石伟杰, 赵琼, 吴小雨, 王志龙, 陈秋红

单位:1. 湖南农业大学 农学院, 水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室, 作物基因工程湖南省重点实验室, 湖南 长沙 410128;;2. 赣州市花卉研究所, 江西 赣州 341413

关键词:水稻,TPT/NST家族,核苷酸单糖,生物信息学分析,逆境胁迫,表达谱分析,

基金:国家自然科学基金项目(31401699;31571995);湖南省自然科学基金项目(2017JJ3112);湖南省教育厅科学研究项目(18B102)

NSTs在细胞中负责将核苷酸单糖转运到高尔基体(Golgi)/内质网(ER)中,为细胞壁多糖分子的生物合成提供底物,水稻NSTs基因的研究将为深入了解植物NSTs蛋白的功能奠定良好基础。通过拟南芥AtURGT基因序列的同源比对,在水稻中发现了一个可能具有转运UDP-鼠李糖/UDP-半乳糖活性的基因,命名为OsURGT1(UDP-L-Rha/UDP-D-Gal transporters)。对其编码蛋白进行了氨基酸组成、进化关系、理化性质、跨膜结构域和高级结构的预测,对其启动子序列进行了顺式作用元件分析,同时还检测并分析了OsURGT1基因在水稻中的组织转录表达谱、激素及非生物胁迫处理诱导表达谱。结果显示:OsURGT1基因全长为3 421 bp,含有5个外显子;CDS全长为996 bp,编码331个氨基酸长度的蛋白,此蛋白被预测是一个疏水性蛋白,含有9个跨膜结构域;蛋白高级结构建模结果表明,其与一个NST模板蛋白高度相似。基因启动子顺式作用元件分析结果表明,OsURGT1基因有可能参与多种激素调控途径和逆境胁迫调控途径。转录表达谱分析结果表明,OsURGT1基因在水稻整个生长发育时期和各个组织部位都有表达,在叶中的表达量相对最高;对6种激素(ABA、Eth、GA、SA、MeJA、2,4-D)处理皆有较强的响应表达;对干旱、低温、盐、氧化、高温、重金属等逆境胁迫也有不同程度的响应表达。综上可知,OsURGT1基因编码一个NST蛋白家族成员,并可能参与部分激素调控和逆境胁迫响应过程。

来源:2020年第5期

《华北农学报》期刊编辑部

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