华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2020年第1期:拟南芥核酸酶基因AtCaN2克隆及功能分析

发布日期:

作者:郭坤元, 张欣欣

单位:1. 湖北省农业科学院 中药材研究所, 国家中药材产业技术体系恩施综合试验站, 湖北 恩施 445000;;2. 湖北省农业科技创新中心中药材分中心, 湖北 恩施 445000;;3. 东北林业大学, 盐碱地生物资源环境研究中心, 黑龙江 哈尔滨 150040

关键词:拟南芥,核酸酶,<i>AtCaN2</i>,亚细胞定位,原核表达,酶活性,

基金:国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-21);湖北省中央引导地方科技发展专项(2018ZYYD013);湖北省技术创新专项(鄂西民族专项)(2017AKB075);恩施州科技计划研究与开发项目(D20180016)

为了研究拟南芥核酸酶AtCaN2基因在植物生长发育过程中的作用与功能,从拟南芥中克隆了核酸酶AtCaN2基因,并对该基因进行生物信息学分析,亚细胞定位分析,蛋白质诱导、表达、纯化及功能研究。结果表明,AtCaN2蛋白等电点为8.45,化学式为C1116H1788N310O335S3,共含有3 552个原子数,为亲水性蛋白;AtCaN2与十字花科亚麻荠的同源性较高,同源性为87.89%,与谷子、高粱和玉米的同源性较低,同源性分别是56.42%,57.35%,56.47%,且在氨基酸序列中间具有高度保守的D-X-D序列;同时进化树分析显示AtCaN2与十字花科亚麻荠的亲缘性最近,与谷子、玉米等禾本科植物的亲缘性比较远,这些结果同氨基酸序列比对的结果一致;亚细胞定位结果显示其定位于细胞质,与预测结果相符;蛋白质诱导和纯化得到大小约为35 ku的His-AtCaN2融合蛋白;Western Blot分析显示,诱导表达的融合蛋白正确翻译表达,且没有出现结构上的断裂或者降解的情况;小量诱导和大量诱导均有点突变后的His-AtCaN2(M)融合蛋白表达,且纯化后得到了点突变His-AtCaN2(M)较单一的条带;蛋白酶活性分析表明,His-AtCaN2融合蛋白对核酸底物具有降解能力,表现出较高的活性,而His-AtCaN2(M)点突变融合蛋白对核酸底物没有降解能力,底物基本上未降解。研究结果可以为下一步在植物体内研究AtCaN2基因的相关机理作用提供基础。

来源:2020年第1期

《华北农学报》期刊编辑部

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