华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2020年第1期:干旱胁迫和复水处理后梭梭转录因子的转录组分析

发布日期:

作者:何江峰, 王力伟, 房永雨, 王蕴华, 王朝, 刘红葵

单位:1. 内蒙古自治区农牧业科学院 生物技术研究中心, 内蒙古 呼和浩特 010031;;2. 内蒙古大学 生命科学学院, 内蒙古 呼和浩特 010020;;3. 内蒙古农业大学 生命科学学院, 内蒙古 呼和浩特 010010

关键词:梭梭,转录因子,转录组测序,干旱胁迫,差异表达,

基金:内蒙古农牧业创新基金项目(2017CXJJM08;2013CXJJN15);内蒙古自治区自然基金项目(2018MS03006)

为了探明梭梭应对干旱胁迫和水分刺激的分子调控机理,利用高通量测序技术对正常浇水(对照,CK)、干旱胁迫组(轻度干旱胁迫组,LWS;中度干旱胁迫组,MWS;重度干旱胁迫组,SWS)和复水组(RSWS)梭梭的转录组和转录因子表达谱进行分析。结果表明:数据经de novo拼接共获得74 641条非冗余Unigene,N50长度1 537 bp,对转录组数据比对、注释后共检测到56个转录因子家族、1 307个转录因子编码基因。与对照组相比,干旱胁迫组和复水组中的差异表达基因均以下调表达方式为主,其中,AP2-EREBP、MYB、bHLH、WRKY、NAC、ABI3VP1家族基因在各胁迫组中均表达且表达数较多。复水组中偏向通过增加AP2-EREBP、WRKY和NAC家族上调编码基因数量来实现梭梭幼苗对水分刺激的应答调节;而干旱组更偏向下调AP2-EREBP和bHLH的编码基因数量来实现幼苗对干旱胁迫的响应。干旱组和复水组测序结果的表达量(FPKM)与用荧光定量PCR法得到的基因表达量之间的相关性分别为0.947 8(P<0.01),0.967 2(P<0.01),结果证实了2种处理产生的差异表达基因数据的有效性。综合而言,AP2-EREBP、MYB和bHLH转录因子家族成员对梭梭干旱胁迫具有正负调控的作用。

来源:2020年第1期

《华北农学报》期刊编辑部

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