华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2020年第1期:北京地区侵染菊花的番茄斑萎病毒分子检测与基因组部分序列分析

发布日期:

作者:金凤媚, 宋建, 薛俊, 陈东亮, 王姝, 张越, 孙海波

单位:1. 天津市农业生物技术研究中心, 天津 300192;;2. 北京市农业生物技术研究中心, 北京 100097

关键词:菊花,番茄斑萎病毒,分子检测,序列分析,

基金:天津市种业科技重大专项(16ZXZYNC00070);天津市农科院青年创新基金(2015GA610);天津市企业科技特派员项目(19JCTPJC58400);天津市农业科技示范推广项目(201901020);天津市农业生物技术研究中心主任基金项目(2019003)

为了确定北京菊花产区是否发生了番茄斑萎病毒病,了解该病毒北京分离物的序列变异情况,对该地区发生的TSWV进行了分子检测,并对该病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RDRP)、多糖蛋白(Gn-Gc)、运动蛋白(NSm)、外壳蛋白(N)、非结构蛋白(NSs)等5个基因进行了序列分析。结果表明,TSWV北京地区菊花分离物(Beijing-jh)的5个编码基因与国内各分离物的进化关系较远,与来自韩国和西班牙的分离物亲缘关系较近。相似性分析表明, N基因是最为保守的基因,核酸平均相似性为97.2%,蛋白为98.6%,RDRP的变异性最大,核酸平均相似性为95.4%,蛋白为96.8%,且Beijing-jh分离物的5个基因编码的氨基酸与来自西班牙分离物的相似性最大,初步表明,该分离物可能是由于贸易活动由国外传入我国。

来源:2020年第1期

《华北农学报》期刊编辑部

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