华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2020年第1期:牦牛ACTA1基因启动子区克隆、DNA甲基化与组织表达相关性分析

发布日期:

作者:杨勤, 柴志欣, 王吉坤, 王会, 钟金城

单位:西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室, 四川 成都 610041

关键词:牦牛,<i>ACTA1</i>基因,启动子区,DNA甲基化,重亚硫酸氢盐测序,组织表达,

基金:四川省科技厅应用基础项目(2019YJ0256);国家肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37);西南民族大学研究生创新型科研项目(CX2018SZ114)

为了探究骨骼肌α肌动蛋白1(ACTA1)基因在肌肉和脂肪等6个组织中的甲基化状态及mRNA表达水平,以类乌齐牦牛、麦洼牦牛为研究对象,成功克隆了牦牛ACTA1基因启动子区序列,且采用重亚硫酸氢盐测序法(BSP)检测ACTA1基因启动子区甲基化模式,并通过实时荧光定量PCR检测ACTA1基因在臀大肌、心脏、肾脏、肺脏、肝脏和脂肪组织中的mRNA表达水平。结果显示,牦牛ACTA1基因转录起始位点上游及第一外显子区部分序列总长为1 028 bp;BSP法分析发现肌肉组织DNA甲基化水平最低,脂肪组织甲基化率最高,其中,类乌齐牦牛臀大肌、心脏、肾脏、肺脏、肝脏和脂肪的甲基化概率分别为6.25%,6.88%,20.00%,16.25%,26.25%,29.38%,麦洼牦牛臀大肌、心脏、肾脏、肺脏、肝脏和脂肪的甲基化概率分别为5.00%,7.50%,18.13%,20.00%,26.25%,28.75%; ACTA1基因mRNA表达量在肾脏、肺脏、肝脏和脂肪均极显著低于臀大肌(P<0.01),且显著低于心脏(P<0.05),类乌齐牦牛和麦洼牦牛心脏mRNA表达量具有显著性差异(P<0.05),类乌齐牦牛肺脏组织甲基化率显著低于麦洼牦牛(P<0.05),其他各组织甲基化率和mRNA表达量差异均不显著(P>0.05),各组织甲基化水平与ACTA1基因mRNA表达量呈极显著负相关(r=-0.797,P=0.002)。结果表明, ACTA1基因DNA甲基化模式对肌肉发育具有一定的调控作用,可为牦牛遗传育种表观遗传标记提供部分数据支持。

来源:2020年第1期

《华北农学报》期刊编辑部

查看华北农学报杂志2020年第1期

联系我们

  • 地址:石家庄市和平西路598号
  • 电话:0311-87652166
  • E-mail:hbnxb@163.com

咨询工作人员