华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2019年第6期:谷子SiWRKY03基因的分子特征与表达分析

发布日期:

作者:宋振君, 李志勇, 王永芳, 刘磊, 白辉, 董志平

单位:1. 河北省农林科学院 谷子研究所, 国家谷子改良中心, 河北省杂粮重点实验室, 河北 石家庄 050035;;2. 河北师范大学 生命科学学院, 河北 石家庄 050024

关键词:谷子,谷子锈病,WRKY转录因子,基因表达,抗病反应,

基金:国家自然科学基金项目(31872880);河北省农林科学院创新工程(F18R494004-01);国家现代农业产业技术体系(CARS-07-13.5-A8);河北省优秀专家出国培训项目

WRKY是参与植物生长发育与抗逆反应的一类转录因子。为了解谷子中SiWRKY03基因的功能,利用生物信息学软件分析了其生物学特征,采用Real-time PCR技术检测了SiWRKY03转录因子在谷子不同组织部位和抗谷锈病过程中的表达丰度变化。结果表明,SiWRKY03基因的开放阅读框全长为1 137 bp,编码378个氨基酸,预测分子质量为39.73 ku,理论等电点(pI)为5.91,含有1个WRKY保守结构域。该蛋白质二级结构的最大元件是无规则卷曲,最小元件为β-转角。进化分析表明,SiWRKY03与糜子(RLM93064.1)和哈氏黍(PAN29607.1)的氨基酸序列同源性最高,为99%。组织表达分析表明,该基因在谷子根、茎、叶和穗中均有表达,其中根中表达量最高,穗中表达量最低,与转录组数据一致。在谷子响应锈菌胁迫反应的120 h内,SiWRKY03基因在抗病反应的12,36 h上调表达,而感病反应过程中无显著性变化,推测SiWRKY03在谷子抗锈病反应中起正调控作用。上述试验结果为进一步研究SiWRKY03基因功能与抗病机制奠定理论基础。

来源:2019年第6期

《华北农学报》期刊编辑部

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