华北农学报

作者：毕欢欢, 张晓雅, 王小敏, 刘玉卫, 巩校东, 谷守芹, 韩建民, 董金皋

单位：1. 河北省植物生理与分子病理学重点实验室, 河北 保定 071001;；2. 泊头职业学院, 河北 泊头 062150

关键词：玉米大斑病菌,基因克隆,几丁质合成酶基因,基因结构,表达模式,

基金：河北省自然科学基金项目（C2017204069；C2017204076；C2016204164）；河北省引进留学人员资助项目（CN201705）；河北省高等学校科学技术研究项目（QN2018096）

为了阐明玉米大斑病菌几丁质合成酶基因StCHS6在病菌生长发育及致病过程中的作用，克隆并解析了该基因及其编码蛋白的结构特征，明确了该基因在病菌生长发育过程中的表达模式。在玉米大斑病菌1号小种菌株01-23中克隆StCHS6，利用生物信息学手段分析该基因的结构特征，并利用已有的病菌重要发育阶段的RNA-Seq数据库信息，明确该基因的表达模式。结果发现，StCHS6位于病菌基因组scaffold_1：2066293-2069876（-）的位置，基因全长为3 584 bp，含有4个内含子和5个外显子；CDS序列大小为2 703 bp，编码900个氨基酸，脂肪指数为81.86，亲水性平均值为-0.178，等电点（PI）为8.36，不稳定指数为36.94，属于碱性稳定型蛋白；保守结构域分析表明，StCHS6蛋白含有几丁质合成酶催化结构域Chitin_synth_1和多个跨膜结构域；亚细胞定位分析推测该蛋白定位于细胞膜上；RNA-Seq数据分析表明，StCHS6在菌丝、分生孢子、芽管、附着胞和侵入钉5个发育时期均有表达，但其表达量有所差异。以芽管时期的表达量为1，菌丝、分生孢子、附着胞和侵入钉时期的表达量分别为芽管时期的3.80，4.97，3.40，2.60倍。为阐明玉米大斑病菌StCHS6的基因结构特征、表达模式及功能奠定了基础。

来源：2019年第6期

《华北农学报》期刊编辑部

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