华北农学报

作者：邹志明, 邹海霞, 张焕, 李绍波, 王鑫, 欧阳解秀

单位：南昌大学 生命科学学院, 江西 南昌 330031

关键词：水稻,组蛋白去乙酰化酶(HDAC),HD2蛋白家族,可变剪接,生物信息学,

基金：国家自然科学基金项目（31560383；31760080）

为了克隆水稻HD2蛋白基因OsHDT703，并分析其存在的可变剪接体。利用生物信息学分析，结合RT-PCR、TA克隆和测序等方法，鉴定1个水稻中全新的HD2蛋白成员（OsHDT703）。结构域分析发现，在其N端含有HD2家族的NPL保守结构域。选取来源于7个物种的16个HD2蛋白，构建蛋白进化树，结果发现，OsHDT703蛋白与OsHDT702蛋白处于同一分支；OsHDT701则处于另一分支，说明水稻中HD2家族蛋白可能存在功能分化。根据预测的不同剪接体设计4对特异性引物，以粳稻中花11叶片和幼穗cDNA为模板，利用RT-PCR扩增，结合TA克隆，通过测序比对，成功鉴定到4种不同可变剪接体序列。由于3号（OsHDT703.3）和4号（OsHDT703.4）剪接体的CDS序列完全相同，所以证明OsHDT703至少存在4种不同可变剪接体。综上所述，鉴定到水稻中1个全新的HD2蛋白，命名为OsHDT703，并且鉴定出至少4种存在可变剪接体，为后续深入研究该基因生物学功能奠定基础。

来源：2019年第4期

《华北农学报》期刊编辑部

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