华北农学报

作者：贾小平, 张博, 全建章, 李剑峰, 王永芳, 袁玺垒

单位：1. 河南科技大学 农学院, 河南 洛阳 471023;；2. 河北省农林科学院 谷子研究所, 国家谷子改良中心, 河北 石家庄 050035

关键词：谷子,光周期,重测序,株高,全基因组关联分析,

基金：国家自然科学基金项目（31471569）

为揭示控制株高的遗传机理，为开展理想株型标记辅助选择育种奠定基础，在海南、洛阳、吉林3个不同种植区光周期条件下调查了98份谷子材料的株高，并对98份谷子材料进行基因组重测序，开展单核苷酸多态性（SNP）位点标记与株高的全基因组关联分析。结果表明：不同光周期条件下谷子株高的变异在58.5~169.3 cm，广义遗传力为0.501，且随着日照时间的延长，谷子株高呈递增的趋势。基因组重测序获得了4 482 208个高质量的SNP位点，主成分分析将98份谷子材料分为3个亚群，连锁不平衡（LD）分析发现谷子基因组LD衰减距离为47.5 kb。全基因组关联分析获得10 703个与株高关联的SNP位点（P<0.000 1），这些位点多在海南种植区短日照条件下检测到，且集中于1号染色体上，只有1号染色体上3个关联SNP位点（SNP13861443、SNP14872616、SNP18601830）能在海南、洛阳2个种植区光周期条件下稳定检测到，说明谷子1号染色体存在海南、洛阳种植区短日照和中日照条件下控制株高的数量性状位点（QTL）。在关联SNP位点候选区域发现3个候选基因，推定为成蛋白的基因（LOC101783280）在外显子区检测到一个SNP位点（SNP14876527），推测该基因可能为控制谷子株高的主要候选基因。

来源：2019年第4期

《华北农学报》期刊编辑部

查看华北农学报杂志2019年第4期