华北农学报

北大核心,JST,CSCD,WJCI,

国内刊号:13-1101/S

国际刊号:1000-7091

华北农学报杂志2019年第4期:黄瓜CsamiR399b及其靶基因CsUBC24的生物信息学分析

发布日期:

作者:常怀成, 罗未蓉, 孙涌栋, 李贞霞, 王广印

单位:河南科技学院 园艺园林学院, 河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心, 河南 新乡 453003

关键词:黄瓜,果实膨大,miR399b,泛素结合酶24,生物信息学分析,

基金:国家自然科学基金项目(31401860);河南省高校科技创新人才支持计划(17HASTIT040)

为深入研究CsamiR399b对黄瓜果实膨大的影响,对CsamiR399b及其靶基因CsUBC24进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR分析了CsamiR399b的表达特性。结果发现,CsamiR399b前体序列含有完整的茎环结构;CsamiR399b在膨大的黄瓜果实中表达量高于开花当天子房和未膨大子房,证实其参与黄瓜果实膨大调控。对靶基因的生物信息学分析发现,CsUBC24蛋白二级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋构成,该蛋白质无信号肽及跨膜结构,定位于细胞核,为可溶性蛋白。系统进化树表明,黄瓜CsUBC24与甜瓜、南瓜和苦瓜等物种UBC24遗传距离较近;通过序列比对和保守域分析发现,各物种UBC24蛋白序列和功能结构域表现出较高的保守性,说明UBC蛋白功能保守。推测CsamiR399b通过调控CsUBC24基因表达参与了黄瓜果实膨大。

来源:2019年第4期

《华北农学报》期刊编辑部

查看华北农学报杂志2019年第4期

联系我们

  • 地址:石家庄市和平西路598号
  • 电话:0311-87652166
  • E-mail:hbnxb@163.com

咨询工作人员